近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所提出線粒體基因組組裝新策略,發(fā)表了7個(gè)高質(zhì)量的高粱細(xì)胞器基因組,揭示了高粱線粒體基因組構(gòu)象之間的差異與高粱馴化歷史的關(guān)系。相關(guān)研究成果發(fā)表在《BMC植物生物學(xué)(BMC Plant Biology)》上。
由于復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變化和長(zhǎng)段的重復(fù)性DNA,高粱的細(xì)胞器基因組組裝十分困難,為解決這一問(wèn)題,科研人員利用線粒體基因組構(gòu)象提出了新型組裝策略,該方法將七種不同的高粱基因組分為三種類(lèi)型,通過(guò)比較基因組學(xué)方法,發(fā)現(xiàn)栽培高粱在東非和西非的兩次獨(dú)立馴化事件均與線粒體基因組結(jié)構(gòu)類(lèi)型相關(guān)聯(lián)??蒲腥藛T進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),這些轉(zhuǎn)移序列在不同材料的染色體區(qū)域間的富集模式不同,這為了解細(xì)胞器轉(zhuǎn)移序列在細(xì)胞核內(nèi)的進(jìn)化以及栽培高粱馴化歷史提供了理論依據(jù)和新思路。
該研究得到深圳市優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才培養(yǎng)-優(yōu)秀青年基礎(chǔ)研究,國(guó)家自然科學(xué)基金,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院“青年英才計(jì)劃”等項(xiàng)目支持。
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